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中國海洋大學(xué)在微生物DMSP/DMS循環(huán)方面取得新進(jìn)展
http://www.gangguanzhidu.com  2025年12月8日  來源:華禹教育網(wǎng)

  12月4日,中國海洋大學(xué)海洋生命學(xué)院、深海圈層與地球系統(tǒng)前沿科學(xué)中心和海洋生物多樣性與進(jìn)化研究所張曉華教授團(tuán)隊在綜合性期刊Advanced Science(《先進(jìn)科學(xué)》)上在線發(fā)表了題為“Two Novel S-methyltransferases Confer Dimethylsulfide Production in Actinomycetota”(放線菌中產(chǎn)生DMS的兩種新型甲基轉(zhuǎn)移酶)的最新研究成果。

  硫化氫(Hydrogen sulfide,H2S)、甲硫醇(Methanethiol,MeSH)和二甲基硫(Dimethylsulfide,DMS)是海洋中主要的含硫氣體,在全球硫循環(huán)、趨化作用及氣候調(diào)節(jié)中發(fā)揮關(guān)鍵作用。微生物可通過S-甲基化作用將具有細(xì)胞毒性的H2S和MeSH轉(zhuǎn)化為無毒的DMS,該過程在陸地與海洋環(huán)境中分別主要由MddA或MddH酶催化完成。然而,海洋和陸地中廣泛分布的放線菌門細(xì)菌含有未知的Mdd酶,導(dǎo)致該代謝途徑的潛力長期被低估。


  圖1. 放線菌中產(chǎn)生DMS的兩種新型甲基轉(zhuǎn)移酶

  基于以上研究背景,張曉華教授團(tuán)隊通過基因文庫構(gòu)建、基因敲除等方法,發(fā)現(xiàn)并鑒定了廣泛存在于放線菌中的兩種甲基轉(zhuǎn)移酶——MddM1和MddM2(圖1)。研究對這兩種酶的催化特性進(jìn)行了系統(tǒng)表征,發(fā)現(xiàn)其催化效率高于MddA,但低于MddH。功能實驗表明,mddM1與mddM2的轉(zhuǎn)錄受H2S、MeSH及氧化應(yīng)激誘導(dǎo),并能將有毒的H2S和MeSH轉(zhuǎn)化為無毒的DMS,有效緩解氧化壓力,顯示出明確的生理解毒功能。MddM1和/或MddM2存在于半數(shù)以上的放線菌門細(xì)菌(包括模式菌種委內(nèi)瑞拉鏈霉菌)中,同時也分布于部分綠彎菌門、酸桿菌門及變形菌門細(xì)菌中。在不同環(huán)境中,mddM1的豐度始終高于mddM2,尤其在土壤與沼澤沉積物中普遍存在。本研究揭示了H2S與MeSH依賴的DMS產(chǎn)生過程的重要性,并特別強調(diào)了放線菌門細(xì)菌在全球DMS合成及硫循環(huán)中的關(guān)鍵作用。

  中國海洋大學(xué)為該研究成果的第一完成單位,張曉華教授與學(xué)校客座教授Jonathan D. Todd教授為共同通訊作者。張曉華教授團(tuán)隊博士后郭瑞紅、博士研究生郭子華、碩士研究生周羿及張?zhí)N慧副教授為共同第一作者。


  圖2. DSMG-Chip芯片的構(gòu)建

  此外,張曉華教授團(tuán)隊近期還在環(huán)境領(lǐng)域知名期刊Environmental Science & Technology(《環(huán)境科學(xué)與技術(shù)》)上發(fā)表了題為“DSMG-Chip: A High-Throughput Degenerate qPCR Chip for Profiling Microbial DMSP and Related Organic Sulfur Metabolic Genes in Diverse Environments”(DSMG-Chip:高通量簡并qPCR芯片精準(zhǔn)解析海洋微生物有機硫代謝基因)的研究論文。該研究開發(fā)了微生物DMSP/DMS循環(huán)高通量簡并qPCR芯片DSMG-Chip,實現(xiàn)了27個有機硫代謝基因的同步絕對定量(圖2)。研究人員將42對簡并引物集成于高通量qPCR芯片,結(jié)合智能數(shù)據(jù)庫構(gòu)建和系統(tǒng)發(fā)育分析,建立了從基因檢測到環(huán)境應(yīng)用的完整技術(shù)體系。基于特異性驗證、靈敏度測試和準(zhǔn)確性評估,證實了芯片在復(fù)雜環(huán)境樣本中的可靠性,并通過多維度生物信息學(xué)分析解析了全球海洋有機硫代謝基因的分布特征和生態(tài)意義。


               張曉華教授研究團(tuán)隊

  中國海洋大學(xué)為該研究成果的第一完成單位,張曉華教授為本文通訊作者,張曉華教授團(tuán)隊博士研究生劉棟和張?zhí)N慧副教授為共同第一作者。

  以上兩項研究工作得到了國家自然科學(xué)基金委資助,是張曉華教授團(tuán)隊圍繞海洋微生物DMSP/DMS代謝取得一系列重要發(fā)現(xiàn)之后的最新標(biāo)志性成果,拓展了微生物驅(qū)動硫循環(huán)領(lǐng)域的新研究方向。

  文:郭子華 張?zhí)N慧

  文章鏈接:

  https://advanced.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/advs.202510141
  https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.est.5c10820
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